分子病理应用的检测样本主要包括石蜡组织、新鲜组织、脱落细胞、全血及其他---等。石蜡切片标本厚度应在4-6μm，切片数量依据组织大小而定。样本对检测结果和分析---，病理---需要对可评估的样本进一步明确病理诊断，并评价标本有无出血、坏死和不利于---的前处理(例如含hcl脱钙液处理)，染色体原位杂交技术服务，病变细胞(如细胞)的总量和比例，避免假阴性。进行ngs检测前需通过病理诊断明确其的性质及含量，根据不同类型选择合适的基因panel测序。组织标本中细胞含量建议达到20%以上，低于此标准可富集后检测。未经病理评估的---结果不可单独用于分子病理---诊断目的。
首先，分子病理诊断为的诊断及鉴别诊断提供了依据，当遇到少见疑难或罕见---时，尤其是通过形态学和免yi组化染色仍不能确定的类型，这时候就需要借助分子病理技术，从基因水平来判断---的异常情况，协助病理医生作出相对准确的诊断并判断该---的预后及转归。应用领域广泛的要数软组织和骨、淋巴造血系统，因为这些系统的相似而不同，单靠镜下表现和已知的已无法满足诊断需求。另外，分子病理检测也常常运用在分子分型中，比如大家熟知的分子分型，通过基因表达谱研究，可将分为管腔a型、b型，her-2阳性型，基底样型。
fish是原位杂交技术大家族中的一员，因其所用探针被荧光物质标记（间接或直接）而得名，该方法在80年代末 被发明，现已从实验室逐步进入---诊断领域。基本原理是荧光标记的---探针在变性后与已变性的靶---在退火 温度下复性；通过荧光显微镜观察荧光信号可在不改变被分析对象（即维持其原位）的前提下对靶---进行分析。dna荧光标记探针是其中常用的一类---探针。利用此探针可对组织、细胞或染色体中的dna进行染色体及基因水平 的分析。荧光标记探针不对环境构成污染，灵敏度能得到保障，可进行多色观察分析，因而可同时使用多个探针，缩 短因单个探针分开使用导致的周期过程和技术障碍。
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